东海环境监测中心是隶属于国家海洋局东海分局的具有独立法人资格的国家机构。它还是国家海洋局东海分局实施东海区域海洋综合管理的技术支持单位,也是东海区域海洋环境监测和评价的技术支持单位。主要从事东海地区海洋环境监测与评价、海洋环境调查与研究、海洋水文气象观测、海洋工程环境影响评价现状调查与评价、海洋倾倒区的选择与划定、海洋利用示范东海环境监测中心作为首批通过国家海洋产业实验室计量认证和实验室资质认证的单位之一,拥有中国国家认证认可监督管理委员会颁发的《资质认证计量认证证书》和国家海洋局颁发的《海域使用论证资质证书》。该中心拥有水文气象、海洋化学和海洋生物生态学方面的专业功能实验室。它有一个1000级的洁净室,可以在国际实验室之间进行检查和比较。它拥有许多先进的海洋勘测和监测设备以及先进的实验室分析仪器。它还可以方便地调用平台,如1000吨的中国巡逻调查船、中国巡逻机和大型浮标。
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